Una plataforma de proteómica espacial analiza más de 860.000 células de islotes humanos, identifica 12 subtipos endocrinos y detecta más de 6.000 proteínas en grupos de unas 100 células.
No es un nuevo test de diabetes. Es una herramienta para conservar la posición de las células y, al mismo tiempo, medir miles de proteínas de poblaciones muy pequeñas. mxDVP combina imagen y espectrometría para mapear más de 860.000 células de islotes humanos, identificar 12 subtipos endocrinos y medir más de 6.000 proteínas en grupos celulares pequeños. Una plataforma de proteómica espacial analiza más de 860.000 células de islotes humanos, identifica 12 subtipos endocrinos y detecta más de 6.000 proteínas en grupos de unas 100 células. En la práctica: Multiplexed Deep Visual Proteomics combina imagen de alta multiplexación, análisis computacional y espectrometría de masas para estudiar células endocrinas dentro de islotes humanos sin perder su contexto espacial.
Los islotes pancreáticos son pequeños, heterogéneos y difíciles de estudiar sin destruir la arquitectura que conecta sus células.
mxDVP intenta conservar esa geografía y añadirle profundidad molecular.
El sistema empieza con imagen multiplexada de secciones de tejido, segmenta células, selecciona poblaciones concretas y después aplica microdisección y espectrometría de masas ultrasensible.
Los investigadores analizaron más de 860.000 células y distinguieron 12 estados endocrinos.
Entre ellos aparecen poblaciones híbridas que expresan combinaciones de rasgos alfa, beta y delta.
La plataforma puede identificar más de 6.000 proteínas a partir de unas 100 células seleccionadas.
Eso permite relacionar proteína, identidad celular y posición dentro del islote con mucha más profundidad que una tinción convencional.
El interés para diabetes es generar mapas funcionales de qué células cambian y dónde, pero todavía falta conectar esos estados con progresión de enfermedad y respuesta terapéutica.
Multiplexed Deep Visual Proteomics combina imagen de alta multiplexación, análisis computacional y espectrometría de masas para estudiar células endocrinas dentro de islotes humanos sin perder su contexto espacial.
El trabajo perfiló más de 860.000 células pancreáticas e identificó 12 subtipos endocrinos.
La técnica alcanzó más de 6.000 proteínas a partir de grupos de unas 100 células y detectó poblaciones raras bihormonales y polihormonales.
Los islotes de Langerhans contienen células alfa, beta, delta y poblaciones minoritarias con plasticidad endocrina.
Muchas técnicas de célula única pierden información espacial al disociar el tejido.
Fuentes: Nature Communications — mxDVP en islotes humanosbioRxiv — versión previa del estudio
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