MEOTIVE analiza más de 1,2 millones de células inmunes y encuentra variantes que controlan la variabilidad de expresión entre células, una capa distinta de la expresión media.
Los estudios clásicos miran la media. Este trabajo mira el ruido biológico: si una variante genética hace que unas células se comporten mucho más distinto que otras. Más de 1,2 millones de células muestran que la genética puede cambiar no solo cuánto se expresa un gen, sino cuánto fluctúa de una célula a otra. MEOTIVE analiza más de 1,2 millones de células inmunes y encuentra variantes que controlan la variabilidad de expresión entre células, una capa distinta de la expresión media. En la práctica: MEOTIVE analiza cómo variantes genéticas cambian no solo la expresión media de un gen, sino también cuánto varía entre células de una misma persona.
Dos personas pueden tener el mismo nivel medio de expresión de un gen y, aun así, organizar esa expresión de forma muy distinta célula a célula.
MEOTIVE fue diseñado para capturar esa diferencia.
Aplicado a 1,2 millones de células de 980 donantes, identificó efectos genéticos sobre la variabilidad de expresión en múltiples tipos de células inmunes.
Dependiendo del tipo celular, entre 14 y 3.488 genes mostraron asociaciones significativas de variabilidad.
2.103 genes compartían señales entre varios tipos celulares.
Un análisis más estricto detectó 55 pares SNP-gen, correspondientes a 34 genes, ligados a dispersión de expresión.
Entre ellos, una variante en RPS26 se asoció con variabilidad extendida entre tipos celulares y menor riesgo de enfermedad autoinmune.
Otra asociación en LYZ fue específica de monocitos y se replicó en una cohorte independiente.
MEOTIVE analiza cómo variantes genéticas cambian no solo la expresión media de un gen, sino también cuánto varía entre células de una misma persona.
El estudio utilizó más de 1,2 millones de células inmunes de 980 donantes.
Identificó miles de asociaciones de variabilidad por tipo celular y 55 pares SNP-gen ligados específicamente a dispersión de expresión.
La mayoría de estudios eQTL pregunta si una variante cambia el nivel medio de expresión de un gen.
MEOTIVE añade otra dimensión: si la misma variante hace que unas células expresen mucho y otras poco.
Fuentes: Nature Communications — MEOTIVE
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