AlphaFold añade más de 8.000 complejos de proteínas virales de 23 familias dentro de un portal de preparación frente a pandemias. Las predicciones requieren validación experimental.
AlphaFold puede sugerir cómo encajan dos proteínas virales, pero esa predicción sigue siendo un mapa para el laboratorio, no una fotografía experimental. El nuevo portal reúne más de 8.000 complejos virales de alta confianza y cubre 23 familias que infectan a humanos. Es una herramienta para generar hipótesis, no una sustitución de la validación experimental. AlphaFold añade más de 8.000 complejos de proteínas virales de 23 familias dentro de un portal de preparación frente a pandemias. Las predicciones requieren validación experimental. En la práctica: La base AlphaFold ha añadido más de 8.000 estructuras predichas de dímeros de proteínas virales dentro de un nuevo portal de preparación frente a pandemias.
AlphaFold está ampliando una de sus zonas más débiles: las proteínas de virus que infectan a humanos.
La base pública ha incorporado más de 8.000 complejos formados por pares de proteínas virales.
Los datos cubren 23 familias de virus e incluyen patógenos relacionados con mpox, sarampión y hepatitis B.
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El equipo analizó 41.774 proteínas procedentes de unos 2.800 virus.
Se generaron decenas de miles de predicciones de homodímeros y cerca de 1,7 millones de heterodímeros, aunque solo las de mayor confianza entraron en la base principal.
La novedad importa porque muchas proteínas virales actúan en conjunto y no como moléculas aisladas.
Los investigadores esperan que el recurso ayude a generar hipótesis para antivirales, anticuerpos y preparación frente a nuevas amenazas.
Pero AlphaFold no sustituye un experimento: una estructura predicha puede orientar dónde mirar, y después hay que comprobarla con biología estructural y ensayos funcionales.
La base AlphaFold ha añadido más de 8.000 estructuras predichas de dímeros de proteínas virales dentro de un nuevo portal de preparación frente a pandemias.
Los datos cubren 23 familias de virus con miembros capaces de infectar a humanos.
El proyecto analizó 41.774 proteínas de alrededor de 2.800 virus y publicó también predicciones adicionales aunque solo una parte alcanzó el umbral de confianza para entrar en la base principal.
La AlphaFold Protein Structure Database ya contiene predicciones para la mayoría de proteínas conocidas, pero los virus estaban peor cubiertos.
El trabajo fue coordinado por investigadores de EMBL-EBI y otros centros internacionales.
Fuentes: Nature — AlphaFold viral
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